课题申报的查重时间并没有固定的规定，是先查重还是后查重，主要取决于具体的情况和要求。

一般来说，在课题申报之前进行查重是一个比较好的选择。这可以帮助申报者及时发现和修改申报书中可能存在的重复或相似之处，避免在评审过程中因为重复率过高而被拒绝。同时，提前查重也可以让申报者有更多的时间来完善申报书，提高申报的质量。

然而，有些情况下，课题申报后查重也是可以的。例如，如果申报者对自己的研究内容非常熟悉，并且有信心申报书中不存在重复或相似的情况，那么可以在申报后再进行查重。此外，有些课题申报机构可能也会要求在提交申报书后进行查重，以确保申报书的原创性和质量。

无论选择何时进行查重，都应该注意使用可靠的查重工具或软件，确保查重结果的准确性和可靠性。同时，还应该注意遵守相关的学术规范和道德标准，避免抄袭和剽窃行为的发生。

请注意，具体的查重时间和要求可能会因不同的课题申报机构和项目而有所不同。因此，在申报课题之前，最好先了解清楚相关的规定和要求，以确保自己的申报书符合要求并能够通过评审。

那么，课题的重复率多少才合格呢

课题的重复率合格标准并没有统一规定，这主要取决于课题主办方或者相关机构的要求。一般来说，课题申报书的查重率不能超过0.65，但这个数字可能会因不同的课题、研究领域、学科等因素有所变动。

例如，在医学和生命科学领域，由于研究过程需要大量的实验数据和临床验证，因此重复率相对较高，可能在20%-30%左右。而在社会科学领域，由于研究方法和思路的多样性，重复率相对较低，可能在10%-20%左右。同时，学术期刊或学术会议上发表论文时，一般要求重复率不能超过一定标准，这个标准也可能在20%-30%左右。但在一些特定的研究领域或项目申报中，对于重复率的要求可能会更加严格，如10%-15%左右。

因此，为了确保课题的重复率合格，课题负责人在提交课题申报书之前，应该使用课题主办方认可的查重工具进行查重。如果发现重复率过高，应及时修改和完善申报书，以确保其原创性和质量。同时，也需要了解所在领域和机构对于课题重复率的标准和要求，以确保申请项目或发表论文的质量。

以上信息仅供参考，具体重复率合格标准应以课题主办方或相关机构的要求为准。